主要應用于粉狀、顆粒、片狀、膠狀等食品、藥品（中草藥材、各種口服液）、營養品、糧食制品、農副產品、牛肉、肉脯、糕點、米粉、方便面、面條、速食品、海產品、調味品、果蔬等的干燥脫水及高效殺菌，茶葉殺青，杏仁、魚干、餅干、花生、桃仁、豆制品、板粟、干果等的烘烤、膨化、殺菌、脫腥、熟化，醬菜、鹵味、各種肉制小包裝的防霉、殺菌、保鮮，以及對各類速凍食品的解凍處理，酒類老熟和催陳處理。
微波是熱效應與非熱效應共同作用的結果，可以穿透塑料、陶瓷、玻璃、竹器皿等，溫度不需要過高，只需要在100℃以下。

微波殺菌特點: 時間短、速度快常規熱力殺菌是通過傳導、對流或輻射等方式將熱量從食品表面傳至內部。要達到殺菌溫度，往往需要較長時間。微波殺菌是微波能與食品以及細菌等微生物直接相互作用，熱效應與非熱效應共同作用，達到快速升溫殺菌作用，處理時間大大縮短，各種物料的殺菌作用一般在3-5分鐘。同時低溫殺菌能保持食品營養成分和傳統風味。